Учился в Вене у Р. Йеттеля. С 1972 по 1986 год был первым кларнетистом Венского симфонического оркестра, с 1986 по 1992 — Симфонического оркестра Берлина. В 1996 году основал трио «Берлин». Концертирует в Европе, Америке и Азии как солист и участник камерных ансамблей. Выступления А. Брандхофера проходили в рамках Зальцбургского фестиваля, музыкальных фестивалей Вены и Берлина.

Регулярно проводит мастер классы в Зальцбурге, Вене, Италии, Швеции, Мексике, Бразилии, Корее и Японии. С 1992 года — профессор Университета Моцартеум в Зальцбурге.